Ban chỉ đạo PCLB&TKCN Cục Y tế Giao thông vận tải đã lập đoàn công tác chỉ đạo các đơn vị y tế GTVT tập trung mọi nguồn lực để thanh khiết môi trường, đảm bảo vô trùng nguồn nước sử dụng, phòng chống dịch bệnh phát sinh đối với tất cả các đơn vị GTVT trong vùng bị ảnh hưởng của bão.
Chịu ảnh hưởng của cơn bão số 9, Bệnh viện GTVT Huế và Bệnh viện GTVT Đà Nẵng bị mất điện, mất nước, đường ra vào bệnh viện đều ngập nhưng do chuẩn bị tốt các bệnh viện vẫn đảm bảo điều trị, cấp cứu an toàn cho những bệnh nhân đang nằm lại và cấp cứu cho trên 20 bệnh nhân ở khu vực xung quanh bị tai nạn thương tích do bão gây ra. Bệnh viện còn là nơi tạm trú đảm bảo an toàn cho hàng trăm người dân trên địa bàn bị mất nhà cửa do bão.
Trong thời gian mưa bão, nhiều tuyến đường bị tắc, đường sắt bị hư hỏng, những chuyến tàu khách Bắc-Nam bị dồn ứ nhiều tại các ga Huế, Lăng Cô, Đà Nẵng...dẫn đến tình trạng rác thải bừa bãi, môi trường bị ô nhiễm nguy hiểm, tiềm ẩn nguy cơ xảy ra nhiều dịch bệnh. Thực hiện chỉ đạo của Cục Y tế GTVT, các bệnh viện đã chủ động thuốc hóa chất và phối hợp với CBCNV của các ga để phun thanh khiết môi trường hàng ngày. Hiện nay bão đã lui, nước đang rút dần để lại những thiệt hại nặng nề về người và vật chất cho nhân dân miền Trung. Bên cạnh đó, một dự báo về tình trạng ô nhiễm môi trường cùng với các dịch bệnh tả, thương hàn, nấm da, đau mắt đỏ...đang đến rất gần nếu Ngành Y tế không triển khai kịp thời các phương án phòng chống.